Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Trappc1Q5NCF2 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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Trappc1Q5NCF2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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Trappc1Q5NCF2 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Abcc4-202ENSMUST00000166646 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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Trappc1Q5NCF2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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Trappc1Q5NCF2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
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