Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rtl5Q5DTT4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms