Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Znf608Q56A10 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf608Q56A10 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms