Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TrmoQ562D6 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms