Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Krtap1-4Q3V2D6 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms