Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms