Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28047Q3US59 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms