Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Elf3Q3UPW2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms