Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms