Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms