Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Ssbp4Q3U4B1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Ssbp4Q3U4B1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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