Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms