Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Rnf149Q3U2C5 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rnf149Q3U2C5 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rnf149Q3U2C5 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rnf149Q3U2C5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rnf149Q3U2C5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rnf149Q3U2C5 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Rnf149Q3U2C5 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rnf149Q3U2C5 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Rnf149Q3U2C5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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