Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc9Q3U0M1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms