Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Trappc13Q3TIR1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Trappc13Q3TIR1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms