Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Gm38215-201ENSMUST00000192321 2233 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ccbe1Q3MI99 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ccbe1Q3MI99 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms