Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
KncnQ307W7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms