Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 4933424L21Rik-201ENSMUST00000142486 1186 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm21818-201ENSMUST00000178828 513 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 3300005D01Rik-204ENSMUST00000181484 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm29471-201ENSMUST00000190527 700 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm29372-201ENSMUST00000191416 364 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm43225-201ENSMUST00000201381 1439 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm5043-201ENSMUST00000202103 820 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm29725-201ENSMUST00000206614 407 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 AC122354.1-201ENSMUST00000222328 702 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Olfr96-201ENSMUST00000078209 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ndufa9-203ENSMUST00000205002 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 H2afb2-201ENSMUST00000118616 348 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm4925-201ENSMUST00000092231 397 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm36595-201ENSMUST00000218830 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm22198-201ENSMUST00000122659 307 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm16199-201ENSMUST00000160032 288 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm5737-201ENSMUST00000208668 1272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rcvrn-201ENSMUST00000021290 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Eif3m-201ENSMUST00000028592 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Rasgrp1-203ENSMUST00000172901 1903 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm11225-201ENSMUST00000118903 1049 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Ly6g6c-203ENSMUST00000174876 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Ush2AQ2QI47 Gm20611-201ENSMUST00000177492 1131 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms