Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trim71Q1PSW8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms