Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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