Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VgfQ0VGU4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VgfQ0VGU4 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VgfQ0VGU4 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VgfQ0VGU4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VgfQ0VGU4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VgfQ0VGU4 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VgfQ0VGU4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VgfQ0VGU4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VgfQ0VGU4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms