Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps8Q0P5W1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps8Q0P5W1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms