Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
TrioQ0KL02 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Zfp787-203ENSMUST00000207331 376 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TrioQ0KL02 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms