Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Pate4Q09098 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms