Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Sh3bp2Q06649 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sh3bp2Q06649 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms