Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Thbs3Q05895 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms