Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms