Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Grin2cQ01098 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms