Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grin2bQ01097 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms