Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

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Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Smarcc1P97496 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Smarcc1P97496 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Smarcc1P97496 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Smarcc1P97496 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Smarcc1P97496 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Smarcc1P97496 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Smarcc1P97496 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Smarcc1P97496 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smarcc1P97496 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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