Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nbr1P97432 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nbr1P97432 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms