Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Psme1P97371 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Psme1P97371 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Psme1P97371 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms