Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acta1P68134 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms