Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Polr2iP60898 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms