Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csrnp3P59055 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csrnp3P59055 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csrnp3P59055 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csrnp3P59055 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csrnp3P59055 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms