Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Usp25P57080 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp25P57080 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Usp25P57080 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp25P57080 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp25P57080 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp25P57080 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp25P57080 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms