Protein–RNA interactions for Protein: P56480

Atp5b, ATP synthase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5bP56480 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Atp5bP56480 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Atp5bP56480 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms