Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
TspoP50637 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
TspoP50637 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
TspoP50637 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms