Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rab11bP46638 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rab11bP46638 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rab11bP46638 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rab11bP46638 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rab11bP46638 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rab11bP46638 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rab11bP46638 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rab11bP46638 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rab11bP46638 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rab11bP46638 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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