Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Grik2P39087 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Grik2P39087 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Grik2P39087 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Grik2P39087 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Grik2P39087 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Grik2P39087 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grik2P39087 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms