Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Upk2P38575 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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