Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RxraP28700 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RxraP28700 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RxraP28700 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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