Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CebpbP28033 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms