Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms