Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms