Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tnnc1P19123 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tnnc1P19123 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms