Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18530 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
P18530 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms