Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01852 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01852 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01852 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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