Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccl20O89093 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms