Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lnx1O70263 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms